Выбор и обоснование критерия оптимальности - важный этап в оценке функционирования всей системы. Системы, отвечающие условию оптимальности по различным критериям, могут существенно различаться по физическим, экологическим и экономическим показателям.

Возможно принятие одного из следующих критериев [1].

1. Достижение максимальной мощности вырабатываемой энергии (любого вида) при заданных энергоресурсах.
2. Достижение максимума экономической эффективности суммарной выработанной энергии с использованием вторичных и возобновляемых ресурсов.
3. Минимизация экологического ущерба от использования местных энергетических ресурсов, в том числе от утилизации сельскохозяйственных и промышленных отходов, разработки местных источников топлива и т. д.
4. Минимизация затрат на строительство объектов малой энергетики на основе ресурсов региона.
5. Комплексный критерий, использующий четыре вышеизложенных подхода при условии назначения весовых коэффициентов по каждому показателю.
6. Представляет собой вариант предыдущего, состоит в поиске полного экстремума при назначении жестких границ допустимых изменений каждого показателя с заданием соответствующих весовых коэффициентов.